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SparkSQL读取HBase数据

Spark lxw1234@qq.com 29587℃ 3评论

关键字： Spark读取HBase、SparkSQL读取HBase、SparkSQL整合Hive读取HBase表、Spark任务本地化调度机制

这里的SparkSQL是指整合了Hive的spark-sql cli（关于SparkSQL和Hive的整合，见文章后面的参考阅读）.
本质上就是通过Hive访问HBase表，具体就是通过hive-hbase-handler（关于Hive和HBase的整合，见文章后面的参考阅读）.

环境篇

hadoop-2.3.0-cdh5.0.0
apache-hive-0.13.1-bin
spark-1.4.0-bin-hadoop2.3
hbase-0.96.1.1-cdh5.0.0

部署情况如下图:

Spark部署

测试集群，将Spark Worker部署在每台DataNode上，是为了最大程度的任务本地化，Spark集群为Standalone模式部署。
其中有三台机器上也部署了RegionServer。
这个部署情况对理解后面提到的任务本地化调度有帮助。

 

配置篇

 

1. 拷贝以下HBase的相关jar包到Spark Master和每个Spark Worker节点上的$SPARK_HOME/lib目录下.
（我尝试用–jars的方式添加之后，不work，所以采用这种土办法）

$HBASE_HOME/lib/hbase-client-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar
$HBASE_HOME/lib/hbase-common-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar
$HBASE_HOME/lib/hbase-protocol-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar
$HBASE_HOME/lib/hbase-server-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar
$HBASE_HOME/lib/htrace-core-2.01.jar
$HBASE_HOME/lib/protobuf-java-2.5.0.jar
$HBASE_HOME/lib/guava-12.0.1.jar

$HIVE_HOME/lib/hive-hbase-handler-0.13.1.jar

 

2.配置每个节点上的$SPARK_HOME/conf/spark-env.sh,将上面的jar包添加到SPARK_CLASSPATH

export SPARK_CLASSPATH=$SPARK_HOME/lib/hbase-client-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar:
		$SPARK_HOME/lib/hbase-common-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar:
		$SPARK_HOME/lib/hbase-protocol-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar:
		$SPARK_HOME/lib/hbase-server-0.96.1.1-cdh5.0.0.jar:
		$SPARK_HOME/lib/htrace-core-2.01.jar:
		$SPARK_HOME/lib/protobuf-java-2.5.0.jar:
		$SPARK_HOME/lib/guava-12.0.1.jar:
		$SPARK_HOME/lib/hive-hbase-handler-0.13.1.jar:
		${SPARK_CLASSPATH}

3.将hbase-site.xml拷贝至${HADOOP_CONF_DIR},由于spark-env.sh中配置了Hadoop配置文件目录${HADOOP_CONF_DIR},因此会将hbase-site.xml加载。
hbase-site.xml中主要是以下几个参数的配置：
<property>
<name>hbase.zookeeper.quorum</name>
<value>zkNode1:2181,zkNode2:2181,zkNode3:2181</value>
<description>HBase使用的zookeeper节点</description>
</property>
<property>
<name>hbase.client.scanner.caching</name>
<value>5000</value>
<description>HBase客户端扫描缓存，对查询性能有很大帮助</description>
</property>

另外还有一个参数：zookeeper.znode.parent=/hbase
是HBase在zk中的根目录，默认为/hbase，视实际情况进行配置。

4.重启Spark集群。

 

使用篇

hbase中有表lxw1234,数据如下：

hbase(main):025:0* scan 'lxw1234'
ROW COLUMN+CELL
lxw1234.com column=f1:c1, timestamp=1435624625198, value=name1
lxw1234.com column=f1:c2, timestamp=1435624591717, value=name2
lxw1234.com column=f2:c1, timestamp=1435624608759, value=age1
lxw1234.com column=f2:c2, timestamp=1435624635261, value=age2
lxw1234.com column=f3:c1, timestamp=1435624662282, value=job1
lxw1234.com column=f3:c2, timestamp=1435624697028, value=job2
lxw1234.com column=f3:c3, timestamp=1435624697065, value=job3
1 row(s) in 0.0350 seconds

进入spark-sql,使用如下语句建表：

CREATE EXTERNAL TABLE lxw1234 (  
rowkey string,  
f1 map<STRING,STRING>,  
f2 map<STRING,STRING>,  
f3 map<STRING,STRING>  
) STORED BY 'org.apache.hadoop.hive.hbase.HBaseStorageHandler'  
WITH SERDEPROPERTIES ("hbase.columns.mapping" = ":key,f1:,f2:,f3:")  
TBLPROPERTIES ("hbase.table.name" = "lxw1234");

建好之后，就可以查询了：

spark-sql> select * from lxw1234;
lxw1234.com     {"c1":"name1","c2":"name2"}     {"c1":"age1","c2":"age2"}       {"c1":"job1","c2":"job2","c3":"job3"}
Time taken: 4.726 seconds, Fetched 1 row(s)
spark-sql> select count(1) from lxw1234;
1
Time taken: 2.46 seconds, Fetched 1 row(s)
spark-sql>

大表查询，消耗的时间和通过Hive用MapReduce查询差不多。

spark-sql> select count(1) from lxw1234_hbase;
53609638                                                                        
Time taken: 335.474 seconds, Fetched 1 row(s)

在spark-sql中通过insert插入数据到HBase表时候报错：

INSERT INTO TABLE lxw1234
SELECT 'row1' AS rowkey,
map('c3','name3') AS f1,
map('c3','age3') AS f2,
map('c4','job3') AS f3
FROM lxw1234_a
limit 1;

org.apache.spark.SparkException: Job aborted due to stage failure: Task 0 in stage 10.0 failed 4 times, 
most recent failure: Lost task 0.3 in stage 10.0 (TID 23, slave013.uniclick.cloud): 
java.lang.ClassCastException: org.apache.hadoop.hive.hbase.HiveHBaseTableOutputFormat cannot be cast to org.apache.hadoop.hive.ql.io.HiveOutputFormat
        at org.apache.spark.sql.hive.SparkHiveWriterContainer.outputFormat$lzycompute(hiveWriterContainers.scala:74)
        at org.apache.spark.sql.hive.SparkHiveWriterContainer.outputFormat(hiveWriterContainers.scala:73)
        at org.apache.spark.sql.hive.SparkHiveWriterContainer.getOutputName(hiveWriterContainers.scala:93)
        at org.apache.spark.sql.hive.SparkHiveWriterContainer.initWriters(hiveWriterContainers.scala:117)
        at org.apache.spark.sql.hive.SparkHiveWriterContainer.executorSideSetup(hiveWriterContainers.scala:86)
        at org.apache.spark.sql.hive.execution.InsertIntoHiveTable.org$apache$spark$sql$hive$execution$InsertIntoHiveTable$$writeToFile$1(InsertIntoHiveTable.scala:99)
        at org.apache.spark.sql.hive.execution.InsertIntoHiveTable$$anonfun$saveAsHiveFile$3.apply(InsertIntoHiveTable.scala:83)
        at org.apache.spark.sql.hive.execution.InsertIntoHiveTable$$anonfun$saveAsHiveFile$3.apply(InsertIntoHiveTable.scala:83)
        at org.apache.spark.scheduler.ResultTask.runTask(ResultTask.scala:63)
        at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:70)
        at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:213)
        at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1145)
        at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:615)
        at java.lang.Thread.run(Thread.java:744)

Driver stacktrace:
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler.org$apache$spark$scheduler$DAGScheduler$$failJobAndIndependentStages(DAGScheduler.scala:1266)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler$$anonfun$abortStage$1.apply(DAGScheduler.scala:1257)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler$$anonfun$abortStage$1.apply(DAGScheduler.scala:1256)
        at scala.collection.mutable.ResizableArray$class.foreach(ResizableArray.scala:59)
        at scala.collection.mutable.ArrayBuffer.foreach(ArrayBuffer.scala:47)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler.abortStage(DAGScheduler.scala:1256)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler$$anonfun$handleTaskSetFailed$1.apply(DAGScheduler.scala:730)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler$$anonfun$handleTaskSetFailed$1.apply(DAGScheduler.scala:730)
        at scala.Option.foreach(Option.scala:236)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGScheduler.handleTaskSetFailed(DAGScheduler.scala:730)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGSchedulerEventProcessLoop.onReceive(DAGScheduler.scala:1450)
        at org.apache.spark.scheduler.DAGSchedulerEventProcessLoop.onReceive(DAGScheduler.scala:1411)
        at org.apache.spark.util.EventLoop$$anon$1.run(EventLoop.scala:48)

这个还有待分析。

 

关于Spark任务本地化运行

先看这张图，该图为运行select * from lxw1234_hbase;这张大表查询时候的任务运行图。

Spark任务运行

Spark和Hadoop MapReduce一样，在任务调度时候都会考虑数据本地化，即”任务向数据靠拢”，尽量将任务分配到数据所在的节点上运行。
基于这点，lxw1234_hbase为HBase中的外部表，Spark在解析时候，通过org.apache.hadoop.hive.hbase.HBaseStorageHandler获取到表lxw1234_hbase在HBase中的region所在的RegionServer，即：slave004、slave005、slave006 （上面的部署图中提到了，总共只有三台RegionServer，就是这三台），所以，在调度任务时候，首先考虑要往这三台节点上分配任务。
表lxw1234_hbase共有10个region，因此需要10个map task来运行。

再看一张图，这是spark-sql cli指定的Executor配置：

Spark WebUI

 

每台机器上Worker的实例为2个，每个Worker实例中运行的Executor为1个，因此，每台机器上运行两个Executor.
那么salve004、slave005、slave006上各运行2个Executor，总共6个，很好，Spark已经第一时间将这6个Task交给这6个Executor去执行了（NODE_LOCAL Tasks）。
剩下4个Task，没办法，想NODE_LOCAL运行，但那三台机器上没有剩余的Executor了，只能分配给其他Worker上的Executor，这4个Task为ANY Tasks。
正如那张任务运行图中所示。

 

写在后面

通过Hive和spark-sql去访问HBase表，只是为统计分析提供了一定的便捷性，个人觉得性能上的优势并不明显。
可能Spark通过API去读取HBase数据，性能更好些吧，以后再试。
另外，spark-sql有一点好处，就是可以先把HBase中的数据cache到一张内存表中，然后在这张内存表中，
通过SQL去统计分析，那就爽多了。

 

相关阅读

SparkSQL与Hive的整合:
http://lxw1234.com/archives/2015/06/294.htm
Hive与HBase的整合:
http://lxw1234.com/archives/2015/06/319.htm

 

 

 

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(3)个小伙伴在吐槽
  1. 这个还有待分析。 这个问题怎么破呢？
    zero2016-08-23 13:26 回复
  2. 我用sparksql访问hbase是通过在hive中建立外部表，但是问题好严重，查询表的时候速度很慢，根据rowkey查询，根本没有走索引，请问是为什么呢！
    tiger2017-02-23 17:35 回复
    • spark 直接 读取hbase 数据？ 请问有JAVA API demo嘛？
      lixin2019-10-16 16:24 回复